La composició de la Junta Rectora aquesta constituïda, de conformitat amb l’article 2 del Reial decret 1317/1995, de 21 de juliol, pels següents 16 membres amb dret a vot:

3- representants del Consell de Mallorca.
2- representants del Consell de Menorca
2- representants del Consell d’Eivissa.
5- representants de la UNED.
1- representant de l’alumnat del Centre Associat de la UNED als Illes Balears, que té la representació conjunta de Mallorca, Menorca i Eivissa.
Dos representants, de les illes que no siguin la de la residència de primer, amb veu, però sense vot.
1- El director del Centre Associat de la UNED als Illes Balears.
1- El representant del personal d’administració i serveis del Centre Associat de la UNED als Illes Balears.
El secretari de la Junta Rectora, amb veu, però sense vot.
Els Coordinadors de les illes, amb veu, però sense vot.

Els membres actuals de la junta rectora són els següents:

Presidenta
Sra. Isabel Maria Busquets Hidalgo	Vicepresidenta primera i consellera executiva de Cultura, Patrimoni	Consell de Mallorca
Vicepresidentes
Sr. Miquel Àngel Maria Ballester	Conseller de Cultura, Educació, Joventut i Esports	Consell de Menorca
Sr. Miquel Costa Tur	Director insular de Cultura, Educació i Patrimoni	Consell d'Eivissa
Vocales
Sr. Lluís Segura Seguí	Director insular de Política Lingüística	Consell de Mallorca
Sr. Jaume Tortella Cànaves	Conseller electe - Vicepresident 1r Institut Mallorquí d'Afers Socials	Consell de Mallorca
Sr. Miguel Ángel Cardona Mercadal	Director Insular d'Educació, Joventut i Esports	Consell de Menorca
Sra. Sara Ramón Roselló	Consellera Departament de Cultura, Educació i Patrimoni	Consell d'Eivissa
Ricardo Mairal Usón	Rector Magnífico UNED	UNED Madrid
Jesús De Andrés Sanz	Vicerrector Centros Asociados UNED	UNED Madrid
Sr. Jesús Martos Martínez	Delegado Estudiantes CA UNED IllesBalears	UNED Baleares
	Delegado de estudiantes Menorca	Aula Menorca
	Delegado de estudiantes Ibiza	Aula Ibiza
Sra. Judit Vega Avelaira	Directora de CA UNED Les Illes Balears	UNED Baleares
Sr. Santiago Alcázar Navarro	Representante Profesores Tutores Illes Balears	UNED Baleares
Sra. Eugenia López García	Representante P.A.S. Illes Balears	UNED Baleares
Sra. Isabel Maciel Torres	Coordinadora UNED Les Illes Balears-Eivissa	UNED Baleares
Sr. Mª Esperanza Pons Juan	Coordinadora UNED Les Illes Balears-Menorca	UNED Baleares
Sr. Joaquín Gamero Herrera	Secretario CA UNED Les Illes Balears	UNED Baleares
Suplentes
Sr. Josep Mallol Vicens	Secretari Tècnic de Cultura, Patrimoni i Política Lingüística	Consell de Mallorca
Sra. Maria Pastor Gelabert	Directora Insular de Cultura	Consell de Mallorca
Sra. Mª Teresa Suárez Genovard	Consellera executiva de presidència del Consell de Mallorca	Consell de Mallorca
Sra. Susana Irene Mora Humbert	Presidenta CIM	Consell de Menorca